La produzione della terza stagione di Chuck fu "in forse" fino all’ultimo momento. Nelle intenzioni della NBC, infatti, la cancellazione dello show non era un'eventualità da escludere, soprattutto a causa degli ascolti non eccezionali registrati dal ciclo precedente. Tuttavia, grazie anche al caloroso sostegno dei fan, che organizzarono alcune iniziative per attirare l'interesse di nuovi spettatori, lo show fu nuovamente rinnovato, ma soltanto con 13 episodi (poi diventati 19), i quali andarono in onda in midseason.